SÚHRN
Úvod: V súčasnosti je transplantácia fekálnej mikrobioty (FMT) zaradená medzi bežné postupy pri liečbe infekcie Clostridioides difficile, pričom prebiehajú klinické štúdie využitia FMT pri črevných zápalových ochoreniach. Dosiaľ nie je objasnený mechanizmus účinku FMT na dysbiotickú mikrobiotu pacientov.
Metódy: S využitím in vitro modelu gastrointestinálneho traktu človeka - SHIME® sme sledovali zmeny v stabilizovanej črevnej mikrobiote pacienta s ulceróznou kolitídou (žena, 27 rokov, ťažký stav - mayo skóre 11). Po stabilizácii črevnej mikrobioty bola podaná FMT črevnej mikrobioty zdravého darcu (muž, 35 rokov) v rozmedzí troch dní dvakrát. Z modelu boli odobrané vzorky za účelom analýz PCR-DGGE, kvantitatívnej PCR a sekvenovania bakteriálneho metagenómu 16S rRNA (NGS). Získané sekvenačné dáta boli spracované v programe Microsoft Excel.
Výsledky: Analýzy PCR-DGGE ukázali pozorovateľný vplyv FMT na črevnú mikrobiotu zvýšením baktériovej diverzity. Sekvenačné dáta potvrdili a objasnili pozorovania PCR-DGGE analýz.
Záver: Práca priniesla informácie o zmenách vyvolaných FMT na črevnú mikrobiotu pozorovaných počas experimentu s in vitro modelom SHIME®.
Kľúčové slová: črevná mikrobiota, ulcerózna kolitída, in vitro model SHIME®, transplantácia fekálnej mikrobioty, sekvenovanie novej generácie.
Lek Obz, 70, 2021, č. 10, s. 350 - 355
René LINK 1, Anna KAMLÁROVÁ 1, Ľuboš AMBRO 1, Adriána LIPTÁKOVÁ 2
1 Ústav experimentálnej medicíny, Lekárska fakulta Univerzita Pavla Jozefa Šafárika, Košice, vedúca RNDr. I. Bertková, PhD.
2 Mikrobiologický ústav Lekárskej fakulty UK a UNB, Bratislava, prednostka doc. MUDr. A. Liptáková, PhD.
Citácia:
LINK R., KAMLÁROVÁ A., AMBRO Ľ., LIPTÁKOVÁ A.: Pilotná štúdia vplyvu fekálnej transplantácie na mikrobiotu modulovanú v in vitro modeli SHIME®. Lek Obz, 70, 2021, č. 10, s. 350 - 355
