Abstrakt
Úvod: Lynchov syndróm je autozomálne dominantné ochorenie charakteristické vznikom onkologických ochorení pred 50. rokom života, predovšetkým hereditárneho nepolypózneho kolorektálneho karcinómu a endometriálneho karcinómu. V rámci prevencie klinickej manifestácie tohto ochorenia je nevyhnutný včasný záchyt pacientov s pozitívnou rodinnou anamnézou a zároveň je potrebné prispôsobiť frekvenciu preventívnych prehliadok u pacientov, u ktorých sa už Lynchov syndróm manifestoval rozvojom onkologického ochorenia.

Súbor a metodika: V našej štúdii sme analyzovali 12 vzoriek endometriálnych karcinómov slovenských pacientok. Nádorové tkanivo bolo fixované v FFPE bločkoch, z ktorých sme vyizolovali DNA pomocou Purigen Ionic® Purification System. Izolovaná DNA bola následne fragmentovaná a spracovaná do sekvenačných knižníc pomocou panelu TruSight Oncology 500 (Illumina). Vzorky boli sekvenované párovým čítaním 2x100 bp na platforme Illumina NovaSeq 6000. Sekvenačné čítania boli mapované na referenčný genóm hg19 pomocou nástroja Burrows–Wheeler Aligner. Varianty boli anotované pomocou platformy PierianDX a Qiagen Ingenuity Variant Analysis. Na základe výstupov bioinformatickej analýzy sme vyhodnotili mutačné profily jednotlivých vzoriek.
Výsledky a záver: V rámci nášho súboru vzoriek sa nám nepodarilo detegovať mutácie v génoch asociovaných s Lynchovym syndrómom, čo pripisujeme obmedzenému súboru vzoriek. Pretože ide o pilotnú štúdiu, v budúcom výskume bude potrebné súbor pacientov rozšíriť a analýzu vzoriek FFPE doplniť o vzorky voľnej cirkulujúcej DNA pre potvrdenie prípadných zárodočných mutácií v mismatch opravných génoch (tab. 3, obr. 2, lit. 59). Text v PDF www.lekarskyobzor.sk.
KĽÚČOVÉ SLOVÁ: Lynchov syndróm, endometriálny karcinóm, kolorektálny karcinóm, mikrosatelitová instabilita, mismatch opravné gény, skríning.
Lek Obz 2023, 72 (6): 251-259

Citácia

SAADE R, KRASNIČANOVÁ L., KODADA D. et al.: Súvisí Lynchov syndróm a endometriálny karcinóm? Lek Obz 2023, 72 (6): 251-259

Is Lynch syndrome associated with endometrial cancer?

Abstract
Background: Lynch syndrome is an autosomal dominant disorder characterized by the onset of oncological disorders before the age of 50, especially hereditary nonpolyposis colorectal cancer and endometrial cancer. As part of the prevention of clinical manifestation of this disorder, early detection of patients with a positive family history is necessary, and at the same time, it is necessary to adjust the frequency of preventive examinations in patients in whom Lynch syndrome has already manifested itself through the development of an oncological disorder.
Patients and methods: In our study, we analyzed 12 endometrial carcinoma samples from Slovak patients. Tumor tissue was fixed in FFPE blocks, from which we isolated DNA using the Purigen Ionic® Purification System. Isolated DNA was subsequently fragmented and processed into sequencing libraries using the TruSight Oncology 500 panel (Illumina). Samples were sequenced by paired-end 2x100 bp reads on Illumina NovaSeq 6000 platform. Sequencing reads were mapped to the hg19 reference genome using the Burrows – Wheeler Aligner tool. Resulting variants were annotated using the PierianDX and Qiagen Ingenuity Variant Analysis tools. We evaluated the mutational landscape of each sample based on the bioinformatics analysis output.
Results and conclusion: We did not manage to detect mutations in genes associated with Lynch syndrome in our sample set, which we attribute to the limited sample set size. Since this is a pilot study, in future research it will be necessary to expand the set of patients and support the analysis of FFPE samples with samples of circulating free DNA to confirm possible germline mutations in mismatch repair genes (Tab. 3, Fig. 2, Ref. 59). Text in PDF www.lekarskyobzor.sk.
KEY WORDS: Lynch syndrome, endometrial cancer, colorectal cancer, microsatellite instability, mismatch repair genes, screening.

Lek Obz 2023, 72 (6): 251-259

Cite

SAADE R, KRASNIČANOVÁ L., KODADA D. et al.: Is Lynch syndrome associated with endometrial cancer? Lek Obz 2023, 72 (6): 251-259

Rami SAADE 1, Lucia KRASNIČANOVÁ 1, Dominik KODADA 1, Nikola JANOŠTIAKOVÁ 1, Michal BERNADIČ 2, Michaela HÝBLOVÁ 3, Vanda REPISKÁ 1

1 Ústav lekárskej biológie, genetiky a klinickej genetiky LF UK a UN Bratislava, prednosta doc. MUDr. D. Böhmer, PhD.
2 Klinika chirurgickej onkológie NOÚ a SZU, Bratislava, prednosta prof. MUDr. D. Pinďák, PhD.
3 Medirex Group Academy, n.o., riaditeľ doc. MUDr. P. Janega, PhD.