Abstrakt
Úvod: Koronavírus SARS-CoV-2 je vírus závažného akútneho respiračného syndrómu, ktorý u ľudí vyvoláva infekčné ochorenie označované COVID-19. V klinickej mikrobiologickej diagnostike vírusu SARS-CoV-2 je reverzná transkriptázová polymerázová reakcia (RT-PCR) považovaná za ideálnu štandardnú metódu.
Metódy: V tejto práci sme porovnávali schopnosť štandardnej RT-PCR metódy (FTDTM SARS-CoV-2 Test) a novej vysokorýchlostnej RT-PCR metódy (NextGenPCRTM SARS-CoV-2 Test) detegovať vírus SARS-CoV-2. Do štúdie bolo zahrnutých celkovo 100 pacientov s podozrením na COVID-19, od ktorých boli odoberané výtery z nazofaryngu a analyzované obomi metódami.
Výsledky: Počet vzoriek, ktoré boli oboma metódami vyhodnotené ako pozitívne, bol 35 a počet vzoriek vyhodnotených oboma metódami ako negatívne bol 62. Pri troch vzorkách sme zaznamenali odlišné výsledky. Zhoda oboch metód dosiahla úroveò 97 %, klinická citlivosť 92,1 % a klinická špecifickosť 100 %.
Záver: Vysokorýchlostná NextGenPCR metóda umožòuje jednoduché spracovanie vzorky, analýzu a vyhodnotenie, poskytuje výsledok v priebehu 57 – 82 minút po odbere vzorky a nevyžaduje si izoláciu RNA. Vzhľadom na dosiahnuté výsledky má táto metóda potenciál uplatniť sa ako diagnostická metóda pri detekcii SARS-CoV-2 aj v klinických laboratóriách. Vo výskume sa môže uplatniť pri detekcii sekvencií génov rôznych mikroorganizmov (tab. 2, lit. 11). Text v PDF www.lekarsky.herba.sk.
KĽÚČOVÉ SLOVÁ: SARS-CoV-2, diagnostika, vysokorýchlostná RT-PCR, NextGenPCR.
Lek Obz 2025, 74 (1): 34-37
High-speed RT-PCR in the diagnostics of the SARS-CoV-2 virus and the possibilities for its further use
Abstract
Introduction: The SARS-CoV-2 coronavirus is a severe acute respiratory syndrome virus that causes the infectious disease known as COVID-19 in humans. In clinical microbiological diagnostics of SARS-CoV-2 virus, the reverse transcriptase polymerase reaction (RT-PCR) is considered the gold standard method.
Methods: In this work we compared the ability of the standard RT-PCR method (FTDTM SARS-CoV-2 Test) and the new ultra-fast RT-PCR method (NextGenPCRTM SARS-CoV-2 Test) to detect the SARS-CoV-2 virus. A total of 100 patients suspected of having COVID-19 were included in the study. Nasopharyngeal swabs were collected from each patient and analyzed by both methods.
Results: The number of samples evaluated as positive by both methods was 35 and the number of samples evaluated as negative by both methods was 62. We recorded different results for three samples. The agreement between both methods reached the level of 97%, clinical sensitivity of 92.1% and clinical specificity of 100%.
Conclusion: The ultra-fast NextGenPCR method allows simple sample processing, analysis, and evaluation, providing a result within 57 - 82 minutes after sample collection and does not require RNA isolation. Considering the results achieved, this method has the potential to be applied as a diagnostic method for the detection of SARS-CoV-2 in clinical laboratories.Additionally, it can be used in research to detect the gene sequences of various microorganisms (Tab. 2, Ref. 11). Text in PDF www.lekarsky.herba.sk.
KEY WORDS: SARS-CoV-2, diagnostics, ultrafast RT-PCR, NextGenPCR.
Lek Obz 2025, 74 (1): 34-37
Katarína ČUROVÁ1, Viera LOVAYOVÁ1, Viliam DONIČ2, Jozef JUREK3, Lenka POTOČŇÁKOVÁ3, Leonard SIEGFRIED1
1Ústav lekárskej a klinickej mikrobiológie, Lekárska fakulta, Univerzita Pavla Jozefa Šafárika, Košice, prednosta Dr.h.c. prof. MUDr. L. Siegfried, CSc.
2Ústav lekárskej fyziológie, Lekárska fakulta, Univerzita Pavla Jozefa Šafárika, Košice, prednosta prof. MUDr. V. Donič, CSc.
3Ústav lekárskej a klinickej mikrobiológie, Univerzitná nemocnica L. Pasteura, Košice, prednosta Dr.h.c. prof. MUDr. L. Siegfried, CSc.
